Обучение игре на духовых инструментах началось с приходом выпускницы УГИИ Нурисламовой Д.М. в 1985 году по классу флейты. В связи с открытием новых классов духовых инструментов (кларнет, саксофон, гобой) в 2004 году струнный отдел был преобразован в струнно-духовой. Учащиеся струнно-духового отдела – постоянные участники школьных и городских мероприятий.

Ежегодно на отдел приходили работать новые преподаватели, поэтому появилась возможность открытия отдела духовых инструментов в 2012 году, который по сей день возглавляет заслуженный работник культуры РБ Нурисламова Д.М. Ведется обучение по специальностям: флейта, гобой, кларнет, саксофон, труба. На отделе работают 10 преподавателей, имеющих высшее музыкальное образование: зав.отделом заслуженный работник культуры РБ Нурисламова Д.М., Абдеев Р.И., Габдрахманова М.А., Гимранов Т.С., Файзрахманов Р.Р, Мухамедьярова А.К., Заблодский А.В.; концертмейстеры: Мамлеева С.М., Дулкарнаева В.С., Шарипова А.У., Фатихова Ю.В., Касимова П.В.

Преподаватели отдела, помимо педагогической деятельности, также активно занимаются и концертной, что, несомненно, оказывает положительное влияние на их педагогическую работу и в целом на музыкальную жизнь города. К примеру, в 2014 и 2015 г.г. преподаватель Гимранов Т.С. дал два сольных концерта на престижной сцене Концертного зала им. Ф.И. Шаляпина УГИИ им. З. Исмагилова, а в 2018 году два концерта с Национальным симфоническим оркестром Республики Башкортостан в качестве солиста.